La gestione dell'Anagrafe vede il coinvolgimento di numerosi soggetti, ma i principali sono naturalmente quelli che intervengono nel ciclo di gestione di un sito contaminato, dalla registrazione nell'Anagrafe alle fasi di caratterizzazione e messa in sicurezza, all'approvazione dei progetti, ai controlli ed alla certificazione finale.
I soggetti coinvolti nella costruzione dell'Anagrafe Regionale dei siti da bonificare sono:

Ogni Ente partecipa all'inserimento in anagrafe dei dati di propria competenza: la Regione inserisce i dati nella sezione finanziaria; le Province inseriscono i dati nelle sezioni anagrafica e procedurale, infine l'Arpa inserisce i dati di natura tecnica.
L'Anagrafe è uno strumento in continuo aggiornamento, che prevede diverse modalità di ingresso dei siti ma non ne prevede l'uscita. I dati di un sito inserito nell'Anagrafe verranno implementati in fasi successive, in funzione del diverso stadio in cui si trova il sito (neo-inserito, messo in sicurezza, con progetto approvato, bonificato, certificato), stadi ai quali corrisponde logicamente un diverso livello di informazioni disponibili ed implementabili nell'Anagrafe.